从法律角度处理支付宝特约商户扣款问题，具体操作如下：
1. **核实授权情况**：登录支付宝，查看“支付设置”中的“免密支付/自动扣费”选项，确认是否开通了相关服务及授权情况。
2. **联系支付宝客服**：若对扣款有疑问，可拨打支付宝客服热线或在线咨询，提供扣款记录及个人信息，请求协助查询扣款原因及处理方案。
3. **联系特约商户**：通过支付宝账单详情或商户联系方式，与特约商户沟通，了解其扣款原因及依据，并要求提供相应证明。
4. **申请退款**：若确认扣款不当，可依据支付宝及商户的退款政策，向支付宝或商户申请退款。注意保存相关证据，如扣款记录、沟通记录等。
5. **投诉与维权**：若支付宝或商户未能及时采取措施解决问题，用户可向消费者协会、市场监管部门或支付宝官方投诉渠道进行投诉。同时，也可考虑通过法律途径维护自身权益。